Je pense que s'il devait y avoir une limite, c'est l'infini. On arrive pas à le concevoir, à le comprendre, d'où les paradoxes qui ont fleuri sur le sujet à l'Antiquité.
Aujourd'hui on est parvenu à "mathématiser" l'infini, mais on ne peut toujours pas le concevoir. Suffit d'essayer d'imaginer des infinis plus grands que d'autres pour se rendre compte de nos limites sur la question.
Mais on pourrait également citer notre compréhension du néant, pas le vide évidemment mais bien le néant, c'est à dire l'absence de temps et d'espace également.
Enfin, je pense que nous sommes limités dans notre compréhension des dimensions. Par exemple, j'ai en ce qui me concerne beaucoup de mal à comprendre vraiment ce qu'un hypercube 4-dimensions représente.